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Il formato standard di una piastra a pozzetti profondi è un piatto da 96 pozzetti, ma sono disponibili anche altri formati, inclusi piatti da 24 pozzetti, 384 pozzetti e 1536 pozzetti. Questi diversi formati offrono flessibilità nella capacità del campione e consentono un uso più efficiente dei reagenti e dello spazio di laboratorio. Per esempio, le piastre a 24 pozzetti sono adatte per studi su piccola scala, mentre le piastre da 384 pozzetti e 1536 pozzetti sono comunemente utilizzate per esperimenti di screening ad alta produttività.